ปี 2542 กระทรวงการคลังโดยกรมบัญชีกลางกำหนดให้มีคณะกรรมการตรวจสอบภาคราชการประจำกระทรวง (คตส.) ทุกกระทรวง และสำหรับกระทรวงการคลังมี ศ.หิรัญ ระดีศรี เป็นประธานคณะกรรมการฯ

ปี 2548 สำนักงาน ก.พ.ร. ออกระเบียบตรวจสอบและประเมินผลภาคราชการ พ.ศ. 2548 โดยมีสาระสำคัญ คือ ยกเลิก คตส. และกำหนดให้มีคณะกรรมการตรวจสอบและประเมินผลภาคราชการ (ค.ต.ป.) พร้อมกับให้มีคณะอนุ ค.ต.ป. กลุ่มต่างๆ (เรียกว่า อ.ค.ต.ป.กลุ่ม...) ซึ่งแต่งตั้งโดยคณะรัฐมนตรี และมีวาระการดำรงตำแหน่ง 4 ปี ซึ่งมี อ.ค.ต.ป.กลุ่มต่างๆ มีดังนี้

ทั้งนี้ มีรายนาม ค.ต.ป. ชุดปัจจุบันที่คณะรัฐมนตรีแต่งตั้ง ประกอบด้วย

1.รัฐมนตรีประจำสำนักนายกรัฐมนตรีเป็นประธาน (นายนิวัฒน์ธำรง บุญทรงไพศาล)

2.กรรมการโดยตำแหน่ง จำนวน 9 คน : 

3.กรรมการผู้ทรงคุณวุฒิ (มีวาระ 4 ปี) จำนวน 9 คน :

ปี 2549 กำหนดให้มีคณะกรรมการตรวจสอบและประเมินผลประจำกระทรวง (ค.ต.ป.ประจำกระทรวง) ซึ่งแต่งตั้งโดยรัฐมนตรีว่าการกระทรวง และมีวาระการดำรงตำแหน่ง 2 ปี